Claude가 64시간 동안 전갈 독에 붙는 단백질을 설계했어요 — 211개 실험해 17개 통과, 데이터 전부 공개
Anthropic이 10월 20일 내부 연구 모델로 전갈 신경독에 붙는 작은 단백질(미니바인더)을 설계한 결과를 공개했어요. 다만 독을 중화하는지는 시험하지 않아 '해독제를 만들었다고 주장하지 않는다'고 직접 밝혔어요.
- Anthropic이 내부 연구 모델(Claude Science 안에서 동작)에 4개 지역 전갈의 신경독 5종에 붙는 단백질 설계를 맡겼어요. 처음 24시간은 혼자 일했고, 사람이 후속 지시 4번을 더해 64시간 뒤 최종 180개를 골랐어요.
- Claude는 설계 도구 12개로 318,484개를 만들고 설계-독소 553,052쌍을 구조 예측해 걸렀어요. 사람이 Claude와 31개를 더해 211개를 실험했고, 17개가 결합체 기준을 통과했어요(모두 독소 1종에만 붙음).
- 여러 독소에 동시에 붙도록 만든 설계는 하나도 기준을 넘지 못했어요. 세포 · 동물 시험은 하지 않아 '해독제를 만들었다고 주장하지 않는다'고 밝혔고, 211개 설계와 데이터를 Hugging Face에 공개했어요.
긴 작업을 에이전트에 맡기는 구조를 참고할 수 있어요. 원문에선 사람이 첫 프롬프트에 대상 · 도구 · 점수와 거르기 규칙을 정했고, 품질 문턱값과 도구 배분은 Claude가 정했어요. 결과 확인은 바깥 실험실 두 곳이 따로 했어요.
Hugging Face에 211개 설계 전부의 예측 구조 · 점수 · 실험 데이터가 있어요. 기준을 통과하지 못한 설계까지 들어 있어서, 내 설계 도구의 점수가 실제 결합 결과와 얼마나 맞는지 견줘 볼 수 있어요.
이 소식을 옮길 때 'AI가 해독제를 만들었다'고 쓰면 틀려요. 원문 낱말대로 '결합체(바인더) 17개, 중화 효과는 아직 시험 안 함'으로 소개하는 게 맞아요.
1. 원문 블로그와 기술 보고서(PDF)를 읽어요. 2. Hugging Face의 Anthropic/scorpion-toxin-binder-design 데이터셋에서 211개 설계 · 예측 구조 · 점수 · 실험 데이터를 살펴봐요. 3. 긴 에이전트 작업을 맡길 땐 첫 지시에 '대상 · 쓸 도구 · 합격 기준'을 적고, 결과는 따로 확인하는 단계를 둬요.
긴 조사 작업을 AI 에이전트에 맡길 때, 첫 지시에 목표 · 도구 · 합격 기준을 적어 두고 중간에는 짧은 후속 지시로 방향만 잡는 방식을 따라 해 보면 좋을 것 같아요. 다만 이 연구처럼 결과를 바깥에서 따로 확인하는 단계는 꼭 두는 게 좋을 것 같아요.
Anthropic이 2026년 10월 20일 연구 블로그에 Claude가 전갈 신경독에 붙는 작은 단백질(미니바인더)을 설계한 결과를 올렸어요. 바인더(결합체)는 특정 대상에 단단히 달라붙는 분자예요. 독소가 신경세포의 나트륨 통로에 붙는 부위를 막으면 독이 통로에 닿지 못하게 할 수 있다는 생각이에요. 실험은 투자 리서치 회사 Citrini Research와 함께 만든 프롬프트로 진행했어요.
원문이 든 배경: 전갈에 쏘이는 사람은 해마다 120만 명 이상이고 3,250명 넘게 숨지며, 대부분 의료 접근이 어려운 지역의 아이들이에요.
무엇을 맡겼나
- 대상: 4개 지역 전갈의 신경독 5종 — 멕시코(Cn2), 브라질(Ts1), 북아프리카(AaH I · AaH II), 중동(LqhIII). 다섯 독소는 전체 모양은 같지만 두 개씩 비교하면 아미노산 서열이 26~62%만 같아요.
- 종류: 독소 하나씩, β 계열 2종(Ts1 · Cn2), α 계열 3종(AaH II · AaH I · LqhIII), 다섯 종 모두에 붙는 설계까지 네 가지를 요청했어요.
- Claude가 정한 것: 독소 구조 고르기(PDB · AlphaFold DB 검색), 독소마다 핫스폿(붙을 아미노산 자리) 5곳, 품질 문턱값, 도구별 비중, 여러 독소용 설계 전략.
숫자로 보면
- 처음 프롬프트 뒤 24시간은 혼자 일했고, 사람이 후속 지시 4번을 더해 64시간 뒤 최종 180개를 골랐어요. Claude가 180개 대부분(가장 강한 Cn2-B1 포함)을 고른 건 세 번째 후속 지시 뒤였어요.
- 설계 도구 12개로 318,484개 설계, 설계-독소 553,052쌍을 한 덩어리로 구조 예측해 걸렀어요. 독소나 알려진 단백질과 닮은 설계는 뺐어요.
- 계산량은 약 1만 GPU 시간. 원문은 대부분의 연구자가 쓸 수 있는 양보다 훨씬 많다고 스스로 적었어요.
- 사람이 Claude와 31개를 더해 모두 211개: 독소 하나용 60개(독소마다 12개), β 계열용 30개, α 계열용 30개, 다섯 종 모두용 91개.
실험 결과
Adaptyv Bio(세포 없이 단백질을 만드는 방식)와 Twist Bioscience(사람 신장 세포에서 Fc 융합 형태로)가 각자 만들어 표면 플라즈몬 공명(SPR)으로 결합 세기를 쟀어요. Claude는 사람의 요청에 따라 단백질 서열을 Twist Bioscience에 이메일로 보냈어요(Claude가 쓴 메일이라고 밝힘).
- 합격 기준: 두 실험실 모두에서 반복 실험마다 결합, KD(해리 상수, 낮을수록 단단함) 1µM 이하, 상관없는 사람 단백질 CLEC12A에는 반응 없음. LqhIII는 Adaptyv Bio에서만 시험했어요.
- 211개 중 17개가 통과, 모두 독소 1종에만 붙었어요: Cn2 7개, AaH II 4개, AaH I 4개, LqhIII 2개.
- 독소 하나용 설계만 보면 60개 중 11개(18%)로, 원문은 보통의 단백질 설계 캠페인과 비슷한 비율이라고 적었어요.
- 여러 독소용 설계는 두 종 이상에 기준을 넘은 것이 하나도 없었어요. 원문은 Claude의 현재 능력 말고도 프롬프트, 도구의 한계, 생물학적으로 가능한지 여부 등을 이유로 들었어요.
- 가장 강한 Cn2-B1 · Cn2-B2는 두 실험실 모두에서 KD가 한 자릿수 나노몰(nM) 수준이었어요. 경쟁 실험으로 보면 생쥐에서 Cn2를 중화했다고 보고된 항체 LR과 같은 자리나 그 근처에 붙는 것으로 보여요.
한계 (원문이 직접 적은 것)
- 독에서 정제한 독소가 아니라, 유전자로 만든 재조합 독소에만 결합을 확인했어요.
- 세포에서 중화되는지(in vitro), 동물에서 효과가 있는지(in vivo) 시험하지 않았어요.
- 그래서 해독제를 만들었다고 주장하지 않는다고 밝혔어요. 비교 대상인 기존 항체 · 나노바디 중 3개는 Cn2나 AaH II에 KD 1nM 미만이고 생쥐 보호 효과도 보였어요.
바깥 전문가 두 명(스페인 국립암연구센터 Susana Vázquez Torres, 덴마크 공과대 Timothy P. Jenkins)은 '유망한 첫걸음'이라고 평했어요. 기술 보고서와 211개 설계 · 예측 구조 · 점수 · 실험 데이터가 모두 공개돼 있어요.
